Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP9O75884 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP9O75884 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms