Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCATO75600 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCATO75600 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCATO75600 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms