Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F6O75461 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms