Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRAMEF4O60810 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms