Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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