Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF1O43189 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF1O43189 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms