Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms