Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APAF1O14727 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APAF1O14727 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APAF1O14727 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APAF1O14727 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms