Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF2Q9Y4G8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms