Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
THSD7AQ9UPZ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD7AQ9UPZ6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms