Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms