Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms