Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms