Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DLL4Q9NR61 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms