Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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