Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms