Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms