Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LIN28AQ9H9Z2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms