Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms