Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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