Protein–RNA interactions for Protein: Q99731

CCL19, C-C motif chemokine 19, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL19Q99731 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL19Q99731 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms