Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNC2Q96PR1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNC2Q96PR1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms