Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPRTQ96BW1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms