Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms