Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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USP9XQ93008 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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USP9XQ93008 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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USP9XQ93008 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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USP9XQ93008 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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USP9XQ93008 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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USP9XQ93008 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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USP9XQ93008 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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USP9XQ93008 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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