Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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GCN1Q92616 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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