Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf40Q8WZ69 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms