Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms