Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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