Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms