Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms