Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms