Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms