Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms