Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms