Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms