Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms