Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FXNQ16595 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FXNQ16595 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FXNQ16595 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FXNQ16595 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FXNQ16595 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FXNQ16595 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FXNQ16595 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FXNQ16595 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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