Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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