Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
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NCOA1Q15788 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
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NCOA1Q15788 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
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NCOA1Q15788 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
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NCOA1Q15788 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
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NCOA1Q15788 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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NCOA1Q15788 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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NCOA1Q15788 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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NCOA1Q15788 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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