Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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