Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PDCD1Q15116 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PDCD1Q15116 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PDCD1Q15116 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PDCD1Q15116 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PDCD1Q15116 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PDCD1Q15116 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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PDCD1Q15116 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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