Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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