Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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