Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms