Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTTNQ14247 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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