Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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