Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCOA4Q13772 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms