Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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