Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms